项目组已为本研究打下了扎实的前期工作基础:
1.成功构建了相分离多肽凝聚体递送平台: 筛选获得具有相分离能力的多肽WWKssKWW,证实其能形成动态可逆的液滴,可高效包裹小分子,并在还原条件下解离释放药物,具备作为递送载体的核心特性。
2.成功筛选并获得核心效应分子K4: 合成并鉴定了一系列KGN衍生物,从中筛选出K4。与KGN相比,K4水溶性显著提高,且在维持软骨细胞表型(促进COL2表达)方面效果更优。
3.初步验证了K4@凝聚体的疗效与安全性: 体外实验证明,K4@凝聚体能高效穿透细胞膜进入软骨细胞,并能穿透软骨外植体屏障;可显著促进软骨基质合成(COL2, Aggrecan),抑制分解代谢(MMP-13)和氧化应激(ROS)。初步的体内外安全性评价显示其具有良好的生物相容性。
4.获得了关键的机制线索: 蛋白质谱分析发现,K4@凝聚体处理显著下调了软骨细胞线粒体呼吸链复合物的多个亚基(NDUFA9, NDUFS1, COX5A),并抑制了“氧化磷酸化”通路,为本项目提出的“代谢重塑”假说提供了直接的科学依据和潜在的研究靶点。
5.深厚的外泌体递送与OA研究积累: 申请人团队长期从事细胞外囊泡治疗OA的研究,在靶向递送KGN、miRNA及基因编辑工具方面取得了系列高水平成果(发表于Biomaterials, Theranostics等期刊,多篇入选ESI高被引),对OA的病理机制和药物递送挑战有深刻理解,为本项目的顺利开展提供了坚实的理论、技术和人才储备。
6.具备完善的研究条件与可行性:项目依托单位拥有先进的科研平台和实验设备,研究团队人员结构合理、技术娴熟,确保了项目实施的可行性。
1.与本项目有关的研究积累和已取得的成绩
1.1 与本项目直接相关的工作基础:相分离多肽凝聚体递送KGN衍生物的前期工作
1. 1.1相分离多肽凝聚体的制备,为本项目研究提供递送载体
前期发现含有独特间隔和贴标序列的分子,包括多肽,可以形成相分离凝聚体,用于药物的包裹和胞内递送。因此选择了各种肽间隔(KssK和RssR)和贴标(FF,FW,WF,WW)氨基酸序列进行化学合成。在不同缓冲液条件下(PBS和DMEM),在生理温度(37⁰C)下,我们从一个多肽库中筛选到WWKssKWW多肽能够形成类似液滴的凝聚体。通过光学显微镜观察到液滴的形成。而其他类似的氨基酸序列形成了固相聚集体或非均匀液滴。WWKssKWW液滴在75秒的时间跨度内表现出动态融合特性,说明其在常温下的相分离行为。WWKssKWW液滴还可以通过液-液相分离封装荧光标记的药物,比如核酸分子。此外,在不同的还原条件处理下(还原性的谷胱甘肽1、5和10 mM)下对WWKssKWW凝聚体液滴发生分散,说明二硫键的还原可以导致相分离液滴的解离。因此,在细胞内液滴可以离散而释放出包裹的药物 (图2)。
图2. 相分离多肽的筛选
(A)相分离多肽的图示。(B) 相分离多肽WWKssKWW在PBS中形成液滴。(C) 时间分辨显微镜显示多肽凝聚体液滴在DMEM缓冲液中的融合。(D) 多肽凝聚体液滴对荧光标记的小分子的富集,以及荧光漂白后修复。 (E) 多肽凝聚体液滴的尺径测量。(F)在还原条件下,多肽二硫键的断裂的化学反应。(G)还原条件下多肽二硫键断裂的HPLC追踪。
1.1.2 KGN衍生物的合成、鉴定及筛选:为本项目研究提供效应分子
(1) KGN衍生物(K1至K9)的合成: 均基于芳酐与氨基联苯类化合物在乙酸溶剂中的缩合反应,通过调整反应底物(如不同取代的邻苯二甲酸酐或萘酐以及不同取代的联苯胺)来获得结构多样的目标产物;反应条件根据底物活性有所差异,如K1的合成需加热至60℃促进溶解与反应,而其余衍生物在室温下进行。反应结束后,通过过滤收集析出的固体粗产物,并依次用乙酸和水洗涤以去除杂质,最后冻干获得纯品。
(2) KGN衍生物的结构鉴定:化合物的结构通过核磁共振氢谱(1H NMR)和高分辨质谱(HRMS)进行确证,特征性的化学位移和精确的分子离子峰与理论计算值高度吻合,验证目标分子的成功合成。
图3. KGN衍生物的合成和鉴定
A. KGN衍生物(K1-K9)的结构示意图; B.KGN衍生物(K1-K9)的质谱鉴定结果。
(3)KGN衍生物(K4)可较好维持软骨细胞表型
利用KGN衍生物与经IL-1β刺激的软骨细胞共培养24小时后,收集细胞RNA,通过实时定量PCR检测II型胶原mRNA的表达水平。结果发现K4刺激后II型胶原mRNA显著性升高(图4 )。因此选择K4进行后续实验。
图 4. 实时定量PCR检测KGN衍生物刺激软骨细胞24小时 II型胶原mRNA表达水平
1.1.3相分离多肽凝聚体可有效递送K4进入软骨细胞,促进软骨基质合成代谢,抑制软骨基质分解代谢,该工作为本项目进一步研究K4@凝聚体治疗OA提供了关键的实验依据
WWKssKWW多肽凝聚体递送负载荧光标记的药物分子与软骨细胞共孵育后,利用流式细胞仪和confocal检测K4@凝聚体进入软骨细胞的情况,显示多肽凝聚体具有很高的穿膜效率(图5A,5B),提示相分离多肽 WWK 载体系统可有效递送 KGN 和 K4进入软骨细胞。WWKssKWW多肽凝聚体递送负载荧光标记的药物分子与软骨外植体共孵育后,冰冻切片结果显示多肽凝聚体有很好的穿透软骨屏障能力(图5C)。
K4、KGN、多肽相分离凝聚体、以及多肽相分离凝聚体分别递送KGN和K4刺激软骨细胞48小时后,收集细胞蛋白,通过Western blot检测蛋白的表达水平。结果发现,与相分离多肽凝聚体递送KGN相比,相分离多肽凝聚体递送K4 刺激后,II型胶原、SOX-9和Aggrecan蛋白水平均显著升高,抑制MMP-13表达,降低ROS表达水平(图6 ),提示相分离多肽凝聚体递送KGN衍生物(K4)可有效维持软骨细胞表型。
图5.相分离多肽凝聚体递送K4穿透屏障进入细胞情况
A.流式细胞和Confocal检测WWKssKWW多肽凝聚体递送荧光标记的药物分子进入软骨细胞情况;B. Confocal检测WWKssKWW多肽凝聚体递送荧光标记的药物分子进入软骨细胞情况;C. 利用软骨外植体检测多肽凝聚体递送药物穿透软骨屏障的情况。
图6.相分离多肽凝聚体递送K4对软骨细胞表型和ROS的影响
A.Western blot检测软骨细胞表型相关蛋白的表达水平;B. Image J 分析WB条带灰度值;
C. 活性氧荧光探针(DCFH-DA)检测ROS的水平。
1.1.4 体内外实验结果提示:相分离多肽凝聚体递送K4具有良好的生物相容性,该结果初步验证了其应用于OA治疗的安全性潜力
为了评价关节腔注射相分离多肽凝聚体递送K4治疗OA的生物安全性,分别通过CCK-8、活/死细胞染色和动物实验进行初步验证。CCK-8检测结果(图6A)显示,KGN与K4在24、48及72小时均能将细胞活力维持在85%以上,表明其无显著细胞毒性,证实了它们在细胞应用中的安全性。活/死细胞染色结果(图7B)与此一致,即使在较高浓度肽处理下,仍以绿色染色的活细胞为主,仅观察到极少量红色染色的死细胞。经关节腔注射相分离多肽 WWK 载体系统递送的 KGN 和 K4 八周后,对心、肝、脾、肺、肾组织进行 HE 染色检测。结果(图7C)显示,实验组与对照组之间无显著统计学差异,表明相分离多肽载体系统具有良好的生物安全性。
图7.相分离多肽凝聚体递送K4治疗OA的生物安全性初步评价
A.CCK8检测结果;B.活/死细胞染色结果;C.动物实验组织切片HE染色。
1.1.5 蛋白质谱结果分析提示:K4@凝聚体显著降低体液免疫反应,抑制软骨细胞线粒体的氧化磷酸化,为本项目深入解析K4@凝聚体治疗OA的分子机制提供了研究靶点
如图8A所示,火山图结果显示K4与处理组(K4@凝聚体)的蛋白质表达谱存在显著差异。与对照组相比,处理组共有65个蛋白质发生显著变化,其中10个显著上调(图中右侧红色点群),55个显著下调(图中左侧绿色点群)。
气泡图(图8B)显示,显著富集的GO-BP术语主要集中在两大聚类:免疫球蛋白介导的免疫反应(Immunoglobulin-mediated immune response)和B淋巴细胞介导的免疫应答B cell mediated immunity。这提示多肽相分离凝聚体递送K4可显著降低体液免疫反应。
GSEA分析结果如图8C所示。我们以归一化富集分数(NES)作为主要参考,并采用 NOM p-val < 0.01 作为显著富集的阈值。结果显示,与对照组相比,处理组中显著变化的3个基因集主要包括‘氧化磷酸化’通路。图8D进一步对氧化磷酸化’通路进行分析。其富集图显示,折线图在基因排序列表的左侧急剧下降,并在列表前部达到一个负向的峰值,表明该通路下的蛋白整体表达趋势是在对照组中高表达,即该通路在处理组中被显著抑制。图中部的‘条形码’区域显示了‘氧化磷酸化’通路各成员在排序列表中的分布。可以直观地看到,这些成员主要集中在列表的右侧(与实验组负相关区域),这与负向的富集分数相符。图下部展示了所有蛋白基于其表达变化的排序值分布,整体形态反映了实验组与对照组之间的表达差异谱。
通过Leading Edge分析,我们进一步提取了对‘氧化磷酸化’通路富集信号贡献最大的核心基因。这些基因(Cox5a;Ndufa9;Ndufs1)在排序列表中紧密聚集于富集峰值的周围,它们是该通路在处理组中的关键执行者,可作为后续验证的候选分子。
图8. 蛋白质谱结果分析
A.火山图中横坐标表示差异倍数(以2为底的对数变换),纵坐标表示显著性水平(以10为底的负对数变换)。每一个点代表一个检测到的蛋白。设定筛选标准为 |Log2FC| ≥ 1 且 P-value < 0.05,图中两条垂直虚线(通常位于x = -1 和 x = 1 处)以及一条水平虚线(位于y = -log10(0.05) 处)圈定了显著差异表达分子的范围. B. GO-BP富集分析展示了显著性排名前8的生物学过程术语。纵坐标代表具体的生物学过程,横坐标代表富集基因比例,圆圈的颜色代表显著性水平(P值),圆圈大小代表富集到的基因数目。C. 基因集富集分析(GSEA)基于所有蛋白根据其差异表达倍数(Log2FC)排序的列表,评估预先定义的基因集(如KEGG通路、GO术语)是否在该排序列表的顶端(实验组中高表达)或底端(对照组中高表达)显著富集。D. 以‘氧化磷酸化’通路为例进行分析。