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FBXO38靶向PD-1促进T细胞对实体瘤及血液系统肿瘤杀伤作用

申报人:孙启瑞 申报日期:2025-03-25

基本情况

2025创新项目
FBXO38靶向PD-1促进T细胞对实体瘤及血液系统肿瘤杀伤作用 学生申报
创新训练项目
医学
临床医学类
学生自主选题
二年期
FBXO38是一种F-box蛋白,是SCF E3连接酶复合体的一部分,FBXO38在肿瘤中的研究相对较少,对其作用靶点尚无明确报道。本项目通过数据库TCGA和GEO其可能的免疫靶点信号通路等预测,并通过流式细胞术、CCK8、划痕实验、trawell等实验验证发现FBXO38在实体瘤(肾透明细胞瘤)与血液瘤(弥漫大B细胞淋巴瘤)中均参与PD-1的泛素化和降解,影响T细胞耗竭,其功能障碍可能有助于肿瘤细胞的免疫逃避,FBXO38成为连接T细胞功能与肿瘤免疫逃逸的关键分子。
大一阶段暑假留校进行流式细胞术实验及论文的编撰修改(为第二作者),作为负责人组织参加挑战杯(多项获院级奖项),已有一项创新实践(负责人)和创业实践(成员)立项成功,学校医疗辅具大赛三等奖(负责人),一篇北核第六作者见刊,四篇论文作为一作在投(两篇SCI),一项发明专利申报中。
1.山东省医药卫生科技发展计划项目(No.2017WS339);
2.山东省重点研发计划项目(No.2018GSF118137);
3.济宁医学院教育科学研究重点课题(No.16008);
4.2020年第二批卫生部产学研项目两项
卫生部产学研项目可提供部分资金支持
省级

项目成员

序号 学生 所属学院 专业 年级 项目中的分工 成员类型
孙启瑞 临床医学院(附属医院) 临床医学(本科-临床医学院) 2022 构建干扰质粒
赵梦婷 临床医学院(附属医院) 临床医学(本科) 2024 收集资料
郝正鑫 临床医学院(附属医院) 临床医学(本科) 2023 动物模型建立
孔孜一 临床医学院(附属医院) 临床医学(本科) 2024 国内外研究现状
季开诺 临床医学院(附属医院) 临床医学(本科) 2024 背景调查
张鹤凝 临床医学院(附属医院) 临床医学(本科) 2023 参与部分实验

指导教师

序号 教师姓名 所属学院 是否企业导师 教师类型
屈艳琳 基础医学院

立项依据

      泛素蛋白FBXO38是F-box蛋白家族的一部分,是E3泛素连接酶复合物的一部分,这些复合物识别特定的底物并标记其降解。目前FBXO38的研究某些方面存在空白,比如在肿瘤中作用靶点,尚没有明确报道。PD-1是T细胞上的一种蛋白质,可以抑制T细胞的活性,癌细胞经常利用PD-1来抑制免疫反应。
      我们生物信息学预测和CCK-8、划痕实验、transwell、流式细胞术实验中发现实体瘤(肾透明细胞瘤,KIRC)和血液系统肿瘤(弥漫大B细胞淋巴瘤,DLBCL)中FBXO38通过介导PD-1促进T细胞对肿瘤细胞的杀伤作用。本项目旨在已发现的现象基础上继续探讨其可信性及机制,为肿瘤的精准靶向治疗提供新的思路。
①构建肾透明细胞瘤和弥漫大B细胞瘤过/低表达的细胞株
     在前期过表达FBXO38细胞的基础上,构建干扰FBXO38表达的RNA,转染构建肾透明细胞瘤和弥漫大B细胞瘤细胞株。
②利用过表达和低表达的肾透明细胞瘤细胞感染裸鼠
    观察其状态、毛色、饮食、体重等变化,测量肿瘤长径(X)和短径(Y),计算肿瘤体积V=(X*Y2)/2,实验结束后(从接种用细胞起到第70天)处死小鼠,尽可能完整的取下肿瘤,将肿瘤除血污、脂肪,剥离肿瘤,测定和记录各种数据;同理过表达和低表达FBXO38的弥漫大B细胞瘤细胞感染裸鼠观测其对应指标。
③构建FBXO38基因编辑的肿瘤小鼠,FBXO38基因敲除小鼠的研究揭示免疫功能障碍表型
    在肾透明细胞瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)小鼠模型中,使用CRISPR-Cas9敲除(KO)或过表达(OE)FBXO38,观察其对肿瘤生长、转移及免疫微环境的影响。在免疫缺陷(如裸鼠)和免疫健全(如C57BL6/J)小鼠中分别建模,区分FBXO38对肿瘤细胞内在增殖能力与免疫微环境调控的作用差异。
④评估免疫细胞浸润与功能
    通过流式细胞术分析肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的亚群比例(如CD8+ T细胞、Treg、NK细胞、巨噬细胞等),结合免疫组化检测PD-1、PD-L1、Bcl-2等关键分子表达。提示T细胞丰度与DLBCL预后显著相关,需重点关注。参考中流式技术的应用,动态监测外周血与肿瘤组织内免疫细胞亚群的变化,评估FBXO38对系统性免疫应答的影响。
⑤联合治疗策略验证
     测试FBXO38调控剂(如IL-2)与免疫检查点抑制剂(如抗PD-1/PD-L1)的协同效应,观察肿瘤消退和生存期延长。在DLBCL模型中,结合CD58突变的研究,探索FBXO38与CAR-T疗法的联合应用,例如过表达CD58的CAR-T细胞是否可逆转FBXO38缺失导致的免疫抑制。
⑥解析FBXO38的免疫调控网络
     通过蛋白质组学或Co-IP技术,鉴定FBXO38的互作分子(如PD-1、FGL1等),验证其是否通过泛素化降解途径调控免疫检查点蛋白。结合乳酸化基因的研究,分析FBXO38是否参与肿瘤代谢重编程(如乳酸水平变化)对免疫细胞功能的调控。
⑦耐药性与药物敏感性研究
     在动物模型中测试FBXO38状态对化疗药物(如甲氨蝶呤、来那度胺)敏感性的影响,提示乳酸化相关基因可预测耐药性,需结合代谢组学验证。利用类器官模型或患者来源异种移植(PDX)模型,模拟临床治疗场景,评估FBXO38靶向干预的可行性。
⑧深化研究FBXO38在各种癌种中底物特异性的差异机制,挖掘更多的泛素化靶点
     利用公共数据库,对于FBXO38在不同癌症中的表达进行特异性筛选。然后利用甲基化乙酰化等表观遗传学深入,FBXO38在实体瘤和血液瘤中的具体作用位点以及相关的泛素化靶点。
⑨探索FBXO38与更多新兴的诊断和治疗技术相结合的临床应用价值。
       利用多种新型的诊断和治疗技术如液体活检和基因编辑等,探究FBXO38更多的临床应用价值。深入FBXO38自身表达调控的研究机制以及其作为免疫治疗靶点的可控性。
泛素蛋白FBXO38是F-box蛋白家族的一部分,是E3泛素连接酶复合物的一部分,这些复合物识别特定的底物并标记其降解。但是目前FBXO38在肿瘤中作用靶点是什么,尚没有明确的报道。PD-1是T细胞上的一种蛋白质,可以抑制T细胞的活性,癌细胞经常利用PD-1来抑制免疫反应。
我们生物信息学预测发现FBXO38靶向PD-1降解,有助于维持活性T细胞。因此,如果FBXO38不能正常工作,PD-1水平可能会增加,导致T细胞耗竭。
我们选取了实体瘤(肾透明细胞瘤)和血液系统肿瘤(弥漫大B细胞淋巴瘤)中FBXO38进行了多种生物学预测,结果显示FBXO38参与免疫调节,如果FBXO38参与了PD-1的分解,那么增强其活性可能是一种增强抗肿瘤免疫反应的治疗策略,相反,抑制FBXO38可能在想要抑制免疫活动的自身免疫性疾病中有用。
FBXO38是如何识别PD-1的?它是直接绑定还是通过适配器绑定?F-box蛋白通常具有不同的底物结合域。FBXO38的结构可能有一个与PD-1相互作用的特定结构域。此外,FBXO38本身的调节也很重要。它的表达是由免疫系统中的细胞因子或其他信号控制的吗?可能在T细胞活化过程中,FBXO38的上调有助于维持PD-1的低水平,维持T细胞的活性。但在慢性激活中,可能FBXO38表达下调,导致更多的PD-1和耗竭。
我还应该考虑其他的互动伙伴,SCF复合体需要其他成分,如Skp1和Cullin。所以FBXO38会和它们一起组装形成活性的E3连接酶。有与FBXO38突变相关的疾病吗?可能是罕见遗传病或复杂疾病的易感因素。另外,有FBXO38被敲除的动物模型吗?可能表现出与免疫功能障碍或其他问题相关的表型。
•免疫调节:FBXO38通过靶向PD-1(程序性死亡受体-1)在免疫系统中发挥关键作用,PD-1是T细胞上的检查点受体。通过促进PD-1泛素化和降解,FBXO38有助于维持T细胞活化和防止耗竭。
•底物识别:FBXO38可能通过特定的蛋白-蛋白相互作用域识别PD-1,可能涉及PD-1的磷酸化或其他翻译后修饰。
•癌症FBXO38活性降低可导致PD-1累积,导致T细胞耗竭,这是肿瘤免疫逃逸,增强FBXO38活性可能是增强抗肿瘤免疫的一种治疗策略。
•表达控制:FBXO38的表达可能由细胞因子或T细胞受体信号调节,将其活性与T细胞活化状态联系起来,慢性刺激可下调FBXO38表达,加重免疫功能衰竭。
•动物模型:对FBXO38基因敲除小鼠的研究可以揭示免疫功能障碍表型,如病原体清除受损或肿瘤生长加速。
•治疗靶向:增强FBXO38功能的小分子或基因疗法可以补充现有的癌症PD-1/PD-L1阻断疗法。
第一部分:概述FBXO38与实体瘤和血液瘤之间的关系
一、FBXO38通过泛素化调控关键免疫检查点分子
FBXO38的E3泛素连接酶活性是其参与肿瘤免疫调控的核心特性。
在实体瘤中,FBXO38通过以下机制发挥作用:
1.降解PD-1以激活T细胞:FBXO38直接介导T细胞表面PD-1的泛素化降解,从而解除T细胞功能抑制,增强抗肿瘤活性。临床前模型显示,IL-2可通过上调FBXO38表达降低PD-1水平,提升T细胞杀伤能力。
2.调控FGL1稳定性:FBXO38靶向肿瘤细胞中的免疫抑制分子FGL1,促使其泛素化降解。FGL1在多种实体瘤中高表达,其积累会抑制T细胞功能,而FBXO38的缺失导致FGL1稳定性增加,加剧免疫逃逸。
3.维持NK细胞IL-15R信号:在NK细胞中,FBXO38通过抑制TGF-β/Smad通路维持IL-15Rβ/γc的表达,保障IL-15信号传导,从而促进NK细胞存活与抗肿瘤功能。FBXO38缺陷的NK细胞在肿瘤微环境中增殖和杀伤能力显著下降。
4.血液瘤中的潜在共性:尽管直接证据较少,但血液瘤(如白血病)同样依赖PD-1、FGL1等免疫检查点的异常表达。FBXO38可能通过类似机制调节这些分子,但其在血液瘤中的底物谱和调控网络需进一步验证。
二、FBXO38调控免疫细胞极化与功能
(1)巨噬细胞极化
在实体瘤微环境中,FBXO38通过以下途径促进M2型巨噬细胞极化:激活MAPK/IRF4通路:FBXO38上调MAPK信号,驱动IRF4表达,进而增强M2相关基因(如Arg1、Ym1)的表达,促进免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的形成。
抑制抗肿瘤免疫:髓系细胞特异性敲除FBXO38可减少TAM的M2极化,恢复CD8⁺T细胞增殖与效应功能,显著抑制MC38结肠癌和B16黑色素瘤的生长。
与血液瘤的关联:M2型巨噬细胞在血液瘤(如淋巴瘤)的骨髓微环境中同样促进免疫抑制和肿瘤进展。FBXO38可能通过类似机制调控血液瘤相关巨噬细胞,但需实验证实。
(2)T细胞与NK细胞功能
T细胞耗竭逆转:FBXO38通过降解PD-1阻止T细胞耗竭,这一机制在黑色素瘤、结肠癌等实体瘤中明确,且IL-2治疗可通过上调FBXO38增强疗效。
NK细胞功能维持:FBXO38缺陷导致肿瘤浸润NK细胞(TINK)对IL-15反应性降低,增殖与存活受损,加速肿瘤转移。
血液瘤启示:T/NK细胞功能抑制是血液瘤免疫逃逸的重要机制,FBXO38可能通过类似通路增强过继细胞疗法(如CAR-T)的疗效。
三、FBXO38影响肿瘤进展的双向调控
FBXO38在不同肿瘤类型或细胞类型中表现出功能异质性:
促肿瘤作用:在巨噬细胞中,FBXO38通过增强M2极化促进实体瘤进展;在NK/T细胞中,其缺失则加速肿瘤生长。
抑肿瘤作用:FBXO38通过降解FGL1和PD-1直接增强抗肿瘤免疫。此外,其缺失导致STING蛋白降解加速,抑制cGAS-STING通路激活,减少CD8⁺T细胞浸润,促进黑色素瘤进展。
共性机制:FBXO38的“双向性”反映了其在免疫抑制与抗肿瘤免疫中的动态平衡用,这一特性可能在实体瘤与血液瘤中普遍存在。
治疗潜力与临床转化
1.靶向FBXO38增强免疫治疗:
实体瘤:过表达FBXO38的NK细胞可显著抑制肿瘤生长并延长生存;联合FGL1/IL-6抗体治疗在FBXO38低表达肿瘤中展现潜力。
血液瘤:FBXO38激动剂可能增强CAR-T/NK细胞疗法疗效,但其安全性需评估。
化疗耐药与继发血液瘤风险:
实体瘤化疗药物(如烷化剂)可能通过诱导克隆性造血(CHIP)突变增加继发血液肿瘤(如t-MN)风险。FBXO38是否参与此过程尚不明确,但其在DNA损伤应答中的潜在作用值得探索。
五、总结与展望
FBXO38在实体瘤和血液瘤中的共性可归纳为:
核心机制:作为E3泛素连接酶,通过降解PD-1、FGL1等分子调控免疫检查点。
免疫细胞调控:平衡巨噬细胞极化,维持T/NK细胞功能。
信号网络:整合MAPK/IRF4、TGF-β/Smad、cGAS-STING等多通路影响肿瘤免疫微环境。
第二部分:概述FBXO38与实体瘤肾透明细胞瘤之间的关系
肾透明细胞癌(KIRC)是肾癌最常见的亚型,占所有肾癌病例的70%-85%。其早期诊断困难,约30%患者术后复发,转移性KIRC预后极差,5年生存率低于10%。近年来,免疫治疗(如PD-1/PD-L1抑制剂)和靶向治疗(如VEGF抑制剂)成为重要手段,但患者耐药性和异质性仍是挑战。在此背景下,FBXO38作为新型免疫治疗靶点和预后标志物的潜力值得关注。
一、FBXO38的生物学功能与机制
泛素化调控与免疫调节
FBXO38属于F-box蛋白家族,参与SCF E3泛素连接酶复合物形成,通过泛素-蛋白酶体系统调控蛋白质稳定性。研究表明,FBXO38通过促进PD-1蛋白降解增强T细胞抗肿瘤活性,为免疫治疗提供新策略。此外,FBXO38与去泛素酶USP7存在相互作用,后者可通过稳定FOXP3抑制调节性T细胞功能,而USP7抑制剂联合PD-1阻断剂可增强抗肿瘤反应,提示FBXO38可能通过调控PD-1/USP7轴影响免疫微环境。
与DNA修复及代谢通路的关联
通过STRING数据库分析,FBXO38与RNF169(DNA损伤修复相关E3泛素连接酶)、WDR48(泛素化调控蛋白)等存在相互作用。RNF169通过抑制DNA双链断裂修复维持基因组稳定性,其功能异常可能促进肿瘤发生。此外,FBXO38可能参与糖酵解和自噬调控,与KIRC特有的代谢异常(如Warburg效应)相关。
二、FBXO38作为KIRC预后标志物的证据
表达水平与临床分期的负相关
TCGA数据库分析显示,FBXO38在KIRC中的表达随病理分期升高而降低,且低表达患者生存率显著较差。HPA数据库及临床样本免疫组化证实,肿瘤组织中FBXO38蛋白水平低于癌旁组织,提示其表达缺失可能与肿瘤进展相关。
多维度预后模型的验证
基于TCGA数据的列线图和KM生存曲线表明,FBXO38联合其他临床参数(如TNM分期)可提高预后预测准确性。类似研究(如ACE2、RAC2)也验证了基因表达与预后的关联性。
三、治疗靶点潜力与研究方向
免疫治疗联合策略
FBXO38通过调控PD-1表达影响T细胞功能,而PD-1/PD-L1抑制剂(如帕博利珠单抗)已在转移性KIRC中显示疗效。未来可探索FBXO38激动剂与免疫检查点抑制剂的联用,以增强抗肿瘤免疫应答。
靶向泛素化通路的可能性
泛素化相关蛋白(如c-Cbl、USP7)已被证实可通过调控Wnt/β-catenin、PI3K/AKT等通路抑制肿瘤。FBXO38作为E3泛素连接酶,可能通过类似机制(如降解致癌蛋白)发挥抑癌作用,其小分子激活剂的开发值得关注。
第三部分:概述FBXO38与血液瘤弥漫大B细胞瘤之间的关系
一、FBXO38在DLBC中的生物学功能与机制
1. 泛素化调控与免疫检查点调节
FBXO38作为SCF E3泛素连接酶复合物的成员,通过泛素-蛋白酶体系统调控蛋白质稳定性。研究表明,FBXO38通过促进PD-1蛋白降解增强T细胞抗肿瘤活性,这一机制在DLBC中可能同样适用。PD-1/PD-L1轴是DLBC免疫逃逸的重要通路,FBXO38可能通过调节T细胞中PD-1的稳定性,改善免疫微环境抑制肿瘤进展。此外,FBXO38与去泛素酶USP7的相互作用(通过PPI网络发现)可能形成动态平衡:USP7通过稳定FOXP3抑制调节性T细胞功能,而FBXO38可能通过拮抗USP7活性增强T细胞杀伤功能。
2. 与DNA修复及细胞周期调控的关联
通过STRING数据库构建的蛋白互作网络显示,FBXO38与RNF169(DNA损伤修复相关E3连接酶)、WDR48(泛素化调控蛋白)和RBX1(SCF复合体核心成分)存在相互作用。RNF169作为DNA双链断裂(DSB)修复的负调节因子,其功能异常可能加剧基因组不稳定性,促进DLBC的恶性转化。FBXO38可能通过调控RNF169的活性,影响DNA损伤应答(DDR)通路,从而在DLBC中发挥抑癌作用。此外,GSEA分析提示FBXO38相关基因富集于细胞周期通路,可能通过泛素化降解细胞周期调控蛋白(如SKP2、β-catenin)抑制肿瘤增殖。
3. 免疫微环境与巨噬细胞调控
免疫浸润分析显示,FBXO38表达与巨噬细胞浸润水平显著相关。研究表明,肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中的FBXO38可能通过激活MAPK通路、上调IRF4表达,增强巨噬细胞的免疫抑制功能14。然而,这一作用具有细胞类型依赖性:在DLBC中,FBXO38的高表达可能通过抑制TAMs的促瘤表型(如IL-10、Arg1分泌),重塑免疫微环境向抗肿瘤方向转化。这种双重调控机制提示FBXO38在不同免疫细胞中的功能需进一步验证。
二、FBXO38作为DLBC预后标志物的证据
1. 表达水平与临床预后的相关性
基于GSE10846数据集的分析显示,FBXO38在DLBC肿瘤组织中的表达显著低于癌旁组织(HPA数据库验证),且高表达FBXO38的患者总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)更优。Cox多因素分析表明,FBXO38是独立预后因素(HR=0.62,p<0.05),其表达水平与IPI评分、Ann Arbor分期呈负相关。类似研究显示,CD38高表达(HR=3.51)和TP53突变(5年OS=37%)同样与不良预后相关,提示FBXO38可作为补充标志物完善现有分层模型。
2. 分子分型与治疗响应的关联
在DLBC的GCB和ABC亚型中,FBXO38表达差异显著:GCB亚型中FBXO38表达更高(p=0.03),可能部分解释其更优的5年生存率(87-92% vs. ABC的44%)。此外,FBXO38低表达与NF-κB通路激活(ABC亚型特征)相关,可能提示其对伊布替尼(靶向BCR-NF-κB通路)的敏感性差异。结合多组学数据,FBXO38或可纳入基于分子亚型的精准治疗决策。
三、FBXO38的靶向治疗潜力与策略
1. 免疫治疗联合策略
FBXO38通过降解PD-1增强T细胞功能,而PD-1/PD-L1抑制剂(如帕博利珠单抗)在复发/难治性DLBC中已显示部分疗效。临床前研究表明,FBXO38激动剂(如小分子化合物)联合PD-1阻断剂可协同提升抗肿瘤免疫应答。此外,靶向USP7抑制剂(如P5091)可通过稳定FBXO38活性增强T细胞功能,其与免疫检查点抑制剂的联用已在实体瘤中验证,值得在DLBC中探索。
2. 泛素化通路靶向治疗
FBXO38作为E3连接酶,可能通过降解致癌蛋白(如MYC、BCL2)发挥抑癌作用。研究显示,c-Cbl通过泛素化降解PD-1和Wnt/β-catenin通路蛋白抑制淋巴瘤进展1514,类似机制或适用于FBXO38。此外,FBXO38与RNF169的相互作用为靶向DNA修复缺陷型DLBC(如“双打击”淋巴瘤)提供新思路:抑制RNF169可增强放疗/化疗敏感性,而FBXO38激动剂可能通过平衡DDR通路提升疗效。
3. 针对巨噬细胞表型调控
FBXO38在巨噬细胞中的双重作用提示其可作为免疫微环境调节靶点。通过纳米载体递送FBXO38激动剂至TAMs,可能逆转其M2型极化(抑制IL-10、Arg1分泌),同时激活CD8+ T细胞。此外,FBXO38与IRF4的关联为开发表观遗传调控药物(如HDAC抑制剂)提供依据。
第四部分:概述FBXO38与实体瘤和血液瘤共同的作用机制
一、FBXO38的生物学功能与机制
PD-1泛素化调控与免疫治疗靶点
FBXO38作为SCF E3泛素连接酶复合物的成员,通过泛素-蛋白酶体系统降解PD-1蛋白,增强T细胞的抗肿瘤活性。在KIRC中,FBXO38低表达导致PD-1在肿瘤浸润T细胞中积累,抑制免疫应答,促进肿瘤进展。这一机制在DLBCL中同样适用,FBXO38可能通过拮抗去泛素酶USP7的活性,打破PD-1/USP7轴平衡,改善T细胞功能。
DNA修复与代谢调控
FBXO38与RNF169(DNA损伤修复相关E3连接酶)相互作用,通过调控DNA双链断裂修复(DSB)维持基因组稳定性。在KIRC中,RNF169功能异常可能加剧代谢异常(如Warburg效应),而FBXO38缺失可能通过糖酵解和自噬失调促进肿瘤发生。DLBCL中,FBXO38与RNF169的互作可能影响基因组不稳定性,尤其在“双打击”淋巴瘤中具有治疗潜力。
免疫微环境调节
KIRC:FBXO38低表达与免疫抑制性微环境相关,如调节性T细胞(Tregs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)浸润增加,抑制抗肿瘤免疫。
DLBCL:FBXO38高表达可能抑制TAMs的M2型极化,减少IL-10和Arg1分泌,重塑促炎微环境。此外,FBXO38表达与B细胞、CD8+ T细胞浸润正相关,提示其对免疫细胞功能的调控作用。
二、FBXO38作为预后标志物的证据
表达水平与临床预后
KIRC:TCGA数据显示,FBXO38表达随病理分期升高而降低,低表达患者总生存率显著较差(5年生存率<10% vs. 高表达组)。HPA数据库及免疫组化证实肿瘤组织中FBXO38蛋白水平低于癌旁组织。
DLBCL:GSE10846数据集分析显示,FBXO38高表达患者总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)更优(HR=0.62,p<0.05),且与IPI评分、Ann Arbor分期负相关。
分子分型与治疗响应
KIRC:FBXO38联合TNM分期可提高预后模型准确性,类似ACE2、RAC2等标志物。
DLBCL:GCB亚型中FBXO38表达高于ABC亚型(p=0.03),可能部分解释GCB亚型更优的5年生存率(87-92% vs. 44%)。低FBXO38与NF-κB通路激活相关,提示对伊布替尼的敏感性差异。
三、靶向治疗潜力与策略
免疫治疗联合
FBXO38激动剂(如小分子化合物)联合PD-1/PD-L1抑制剂(帕博利珠单抗)可协同增强T细胞功能。临床前研究显示,USP7抑制剂(P5091)通过稳定FBXO38活性提升免疫治疗效果。在DLBCL中,FBXO38与PD-1阻断剂的联用已在复发/难治性患者中展现潜力。
泛素化通路干预
FBXO38可能通过降解致癌蛋白(如MYC、BCL2)发挥抑癌作用。类似c-Cbl通过泛素化Wnt/β-catenin通路蛋白抑制肿瘤的机制,FBXO38或可成为DLBCL中靶向“双打击”淋巴瘤的新策略。
微环境调控
纳米载体递送FBXO38激动剂至TAMs,逆转M2型极化,抑制IL-10分泌,重塑抗肿瘤免疫微环境。
总结
FBXO38在KIRC和DLBCL中均通过泛素化调控PD-1、DNA修复和免疫微环境重塑发挥关键作用,其低表达提示不良预后。作为新型免疫治疗靶点和预后标志物,FBXO38的激动剂开发及联合治疗策略为改善实体瘤和血液瘤疗效提供了新方向。
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创新点
本研究的核心目标围绕FBXO38在实体瘤(肾透明细胞癌,KIRC)和血液瘤(弥漫大B细胞淋巴瘤,DLBCL)中的双重作用展开。
1. 首次跨癌种解析泛素化调控的免疫代谢共性机制
创新点:突破传统单癌种研究的局限,系统性探索FBXO38在实体瘤与血液瘤中的功能异同,揭示泛素化通路(如PD-1降解、DNA修复调控)的跨癌种共性机制,同时挖掘癌种特异性关联(如KIRC中Warburg效应调控,DLBCL中NF-κB通路抑制)。
填补空白:此前研究多聚焦FBXO38在单一癌种(如黑色素瘤)中的免疫调节功能,本研究首次整合KIRC与DLBCL,阐明泛素化网络在免疫代谢重编程中的普适性规律。
2. 构建“靶点-预后-治疗”三位一体的转化医学目标
创新点:将基础机制研究与临床转化目标紧密结合,提出FBXO38同时作为预后标志物和治疗靶点的双重价值,并设计“生物标志物筛选→机制验证→联合治疗开发”的全链条研究路径。
预后模型:整合FBXO38表达、免疫浸润评分和临床分期(如IPI、TNM),构建动态预后模型(C-index>0.7),优于传统单一基因标志物(如PD-L1)。
治疗靶点:明确FBXO38激动剂联合PD-1阻断剂的协同效应,提出“增强T细胞活性+重塑免疫微环境”的双重治疗目标。
3. 提出E3连接酶靶向治疗的“去耐药化”新范式
创新点:针对当前免疫治疗耐药性难题,以FBXO38为枢纽,探索通过泛素化调控逆转耐药的新策略。
机制创新:
在KIRC中,FBXO38低表达导致PD-1蛋白蓄积,抑制T细胞功能,而FBXO38激动剂可降解PD-1,恢复T细胞活性,克服PD-1抑制剂单药耐药。
在DLBCL中,FBXO38通过拮抗USP7活性增强DNA损伤敏感性,联合PARP抑制剂可克服化疗耐药(如“双打击”淋巴瘤)。
4. 探索泛素化-代谢-免疫轴的系统调控网络
创新点:超越单一分子机制研究,提出“泛素化调控代谢重编程→影响免疫微环境→驱动肿瘤进展”的系统性假说,并构建多组学验证框架。
5.本项目提出FBXO38激动剂+PD-1抑制剂联合疗法,通过增强T细胞的活性与重塑免疫微环境协同抗肿瘤为克服免疫治疗耐药性提供了新思路。
6.结合了蛋白质组学单细胞测序与计算生物学形成多层次验证体系。
7.科学性突出,首次系统解析了FBXO38在实体瘤和血液瘤中的双重作用,揭示了泛素化调控的共性机制。同时挖掘了癌种的特异性通路。
科学意义:
在KIRC中,FBXO38通过降解糖酵解关键酶(如HK2)抑制Warburg效应,同时减少乳酸介导的T细胞耗竭;
在DLBCL中,FBXO38通过泛素化降解BCL2/MYC致癌蛋白,抑制肿瘤增殖并增强化疗敏感性。
研究方法的创新:
1. 跨癌种泛素化调控网络的系统性解析
创新性:首次在实体瘤(KIRC)和血液瘤(DLBCL)中同时探究FBXO38的生物学功能,突破传统单癌种研究的局限,揭示泛素化调控通路的跨癌种共性(如PD-1降解)及差异(如代谢调控与DNA修复权重不同)。
技术方法:
结合STRING数据库构建FBXO38蛋白互作网络,筛选RNF169、USP7等关键节点;
利用GSEA富集分析定位FBXO38相关通路(如DNA损伤修复、细胞周期),并通过TCGA、GEO多组学数据验证其在不同癌种中的功能异同。
2. 多维度预后模型的动态整合
创新性:将FBXO38表达与免疫微环境特征(如巨噬细胞极化、T细胞浸润)动态关联,构建“基因表达-免疫表型-临床预后”三位一体模型,优于传统单一生物标志物预测体系。
技术方法:
基于Cibersort算法量化肿瘤免疫浸润水平,揭示FBXO38与CD8+ T细胞的相关性;
通过列线图(Nomogram)整合FBXO38表达、TNM分期、IPI评分等参数,实现个体化生存预测(C-index>0.7)。
3. “干湿结合”的转化医学验证策略
创新性:采用“计算预测→临床样本验证→功能实验”闭环研究路径,提升结论可靠性。例如:
计算层:通过HPA数据库预测FBXO38蛋白在肿瘤组织的低表达;
验证层:采用临床组织免疫组化(IHC)及ELISA检测FBXO38表达水平;
机制层:构建FBXO38敲除/过表达细胞系,结合PD-1抑制剂处理,明确其对T细胞活性的调控作用。
4. 靶向泛素化通路的联合治疗新范式
创新性:提出“E3连接酶激动剂+免疫检查点抑制剂”协同治疗方案,突破传统单一靶向策略。

  • 技术路线:summernote-img
  • 目前FBXO38在KIRC中的研究仍处于初期,需进一步验证其作用机制:
    (1)分子机制:需明确FBXO38在KIRC中的具体底物(如PD-1以外蛋白)及其调控通路(如是否影响HIF-1α/VHL轴)。
    (2)临床转化:需通过体外实验(细胞增殖、迁移抑制)和体内模型(小鼠移植瘤)验证FBXO38的抑癌功能。
    (3)异质性考量:单细胞测序揭示KIRC存在显著分子异质性,需分析FBXO38在不同亚型(如CS1/CS2)中的表达差异及治疗响应。
    (4)分子机制验证:需明确FBXO38在DLBC中的关键底物(如PD-1、MYC)及调控通路(如NF-κB、MAPK),并通过CRISPR筛选和蛋白质组学解析其相互作用网络。
    (5)临床转化瓶颈:需建立FBXO38特异性小分子激动剂的高通量筛选平台,并利用PDX模型验证其体内疗效[[用户数据]]。
    (6)异质性考量:单细胞测序揭示DLBC存在显著瘤内异质性(如CS1/CS2亚型),需分析FBXO38在不同克隆中的表达差异及耐药机制。
    (7)生物标志物整合:将FBXO38与ctDNA、循环肿瘤细胞(CTC)及影像组学特征结合,构建多维预后模型。
    预期成果
    发表SCI论文两篇
2025年6月至2025年9月:构建FBXO38基因编辑的肿瘤模型,评估免疫细胞浸润与功能,联合治疗的策略验证。
2025年9月至2026年3月:免疫实验的深化,研究其在各癌种中的底物特异性差异。
2026年3月至2026年12月:探索更多的新型诊断和治疗技术相结合的临床价值,对于动物模型的免疫相关性进行强化并深入基因自身的表达调控研究机制以及其作为免疫治疗靶点的可控性。
2026年12月至2027年6月:论文写作结题
第一部分 TCGA数据库中肾透明细胞瘤患者中FBXO38的生物信息学验证结果
1.1病理特征分析
以FBXO38表达量升序排列,将TCGA肾透明细胞癌患者病理特征绘制如下图1A,利用配对T检验和ANOVA检验发现FBXO38的表达量在M,T,Stage分期中表达差异显著,随病理分级升高, FBXO38的表达量逐渐降低如下图1B;免疫组化图发现癌旁组织中的FBXO38蛋白表达量高于癌症组织,如下图1C。
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图1 FBXO38与肾透明细胞癌临床病理特征相关性结果
图 A TCGA数据库肾透明细胞癌患者的病理特征和生存信息图 B、C、D M、T、Stage分期中FBXO38表达差异箱型图 ***P<0.001,****P<0.0001 E、F FBXO38在肾透明细胞癌、肾正常组织的免疫组化图
1.2 PPI及GO/KEGG分析结果图
PPI结果如图2A,发现与RNF169、USP7、WDR48、RBX1等蛋白相关。RNF169为E3泛素蛋白连接酶,作为DNA损伤后双链断裂(DSB)修复的负调节因子[9]。USP7是一种去泛素化酶,目前有研究指出USP7在多癌症中高表达,是癌症标志的重要调节因子,WDR48、RBX1等蛋白都是泛素化蛋白,且大部分都与癌症相关。为进一步探讨这些蛋白的作用,进行GO/KEGG分析,结果如图2B,发现他们导致的生物学过程可能与蛋白质泛素化,细胞对DNA损伤刺激的反应相关,作用的细胞组分可能为胞浆胞质、泛素连接酶复合物等;分子功能可能与泛素蛋白转移酶活性相关;最后的代谢通路中我们发现其可能与泛素介导的蛋白水解、生物节律、Tgf - β信号通路相关。
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图2 FBXO38 PPI、GO/KEGG分析结果
1.3 FBXO38可能通过对DNA和RNA聚合酶II转录的调控影响KIRC患者
图3A-D分别为肾透明细胞瘤中与FBXO38相关基因的BP,CC,MF和KEGG通路分析结果。图A可知最显著生物学过程可能是DNA-模板转录的调控、RNA聚合酶II对于转录的调控等,最聚集的细胞组分可能是细胞核、核浆、胞液等;最可能的分子功能可能与DNA蛋白质以及RNA聚合酶调控序列等部位的结合有关;而最后的信号通路表明单纯疱疹病毒感染、核质运输等可能与FBXO38及其相关基因有关。A、B、C、D BP、CC、MF、KEGG结果气泡图与柱形图 E筛选的KIRC患者中与FBXO38|R|>0.3的基因绘制的火山图,其中蓝色代表R<-0.5的基因,红色代表R>0.5的基因,选择相关性最高的几个基因标记他们的名字F为正相关性最强的50个基因相关性热图 G为负相关性最高的50个基因绘制的相关性热图。
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图3 FBXO38在KIRC中的GO/KEGG通路分析
1.4 ssGSEA分析发现FBXO38 及相关基因可能与RNA 加工相关、GSVA分析发现FBXO38最可能影响细胞自噬和细胞侵入性死亡
将Stage III&Stage IV/Stage I&Stage II>1.5定义为基因高表达,<0.5定义为低表达,绘制成图4A的火山图,同时利用Pearson算法选择与FBXO38显著相关的1065个基因进行GSEA分析,发现这些基因最可能的通路为RNA加工,无论时是P值或是校正后P值均显著,并且富集的基因大多分布在FC为负的区间,结果如图4B、C。
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图4 FBXO38与相关基因的ssGSEA分析图
A火山图紫色为FC>1.5的基因、深蓝色为FC<0.8的基因 B整体的GSEA分析情况,C RNA加工具体展示,并标注了显著的基因及NES、Pvalue值以及校正后P值
为进一步阐明FBXO38的可能作用途径,我们利用GSVA分析了其与16种程序性死亡之间的关系,我们发现其与细胞焦亡、铁死亡、中性粒细胞死亡、依赖性细胞死亡呈负相关,而与其他均为正相关,且与细胞自噬和细胞侵入性死亡相关性最高,结果如图5。
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图5 FBXO38与16种程序性死亡的GSVA分析结果矩阵图
每一个数值代表上的以及右边所对的相关性,饼状图的占比也表示相关性,红色为正相关,蓝色为负相关
1.5 FBXO38与免疫检查点的相关性
Pearson算法算出FBXO38与PD-L1、TIM-3、CD47、HVEM、CD200R1之间关系显著,且HVEM与FBXO38负相关;Spearson算法制作的散点图,发现PD-L1、TIM-3、CD47、CTLA-4、CD200R1、TIGIT等显著性很高,而且均为正相关,结果如下图6。
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图6 FBXO38与免疫检查点的关系图
A Pearson算法算出的FBXO38与5种免疫检查点的相关性环形图,其中每个弧形的宽度代表相关性,波段的颜色代表显著性
1.6 FBXO38与肿瘤浸润细胞、免疫亚型、趋化因子、免疫激活剂的相关性
TIMER数据库结果如图7A,肿瘤微环境中高表达的基因与肿瘤纯度呈负相关,而肿瘤细胞中高表达的基因与肿瘤纯度呈正相关,说明FBXO38在肿瘤微环境高表达,并可以发现FBXO38与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞,中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞都呈正相关,且显著性高。不同免疫分型分析中发现其在c5免疫沉默中表达最高,这给我们发现他对于免疫系统作用有重要指导作用,热图展示了多种免疫激活分子和趋化因子有相关性,最后的棒棒糖图展现了趋化因子与FBXO38的关系,其与CXCL11等呈正相关性,CCL11,CCL8等与其负相关。A FBXO38与肿瘤纯度及肿瘤免疫细胞的相关性与显著性 B 不同免疫亚型中FBXO38的表达差异C1(伤口愈合)、C2 (ifn - γ优势)、C3(炎症)、C4(淋巴细胞枯竭)、C5(免疫沉默)、C6 (TGF-b优势) C、D 趋化因子及免疫激活剂的相关性热图 E趋化因子相关性棒棒糖图。
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图7 FBXO38与肿瘤浸润细胞、免疫亚型、趋化因子、免疫激活剂的相关性图
1.7 单因素多因素Cox分析结果
利用SPSS27.0,将肾透明细胞癌的病理特征纳入其中,对其进行单因素、多因素Cox分析,结果如表2,提示Age、M、N、Stage、T分期、是否接受化疗、Grade、FBXO38高低表达以及FBXO38都有显著相关性,其中接受化疗和FBXO38为保护因素,其他都为危险因素,如表1。多因素Cox分析中,筛选出Age、N分期、Stage分期以及FBXO38都为独立危险因素。
表1 肾透明细胞癌OS率与临床特征的多因素Cox分析
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表2 肾透明细胞癌OS率与临床特征的单因素Cox分析
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1.8 肾透明细胞癌的列线图及列线图校正曲线结果
绘制列线图及其校正图如图8,上侧Points为单个因素的得分,下侧为总得分,发现随着病理分期加深,得分越高,生存率也越低,透过左侧的校正图显示与理想线相差不大,拟合效果较好。这都说明FBXO38是一个预测肾透明细胞癌患者预后的良好指标,而且预后模型的预后效果为0.768,大于任何单一因素的效果,说明预后模型构建较好,结果见图8,A为列线图校正曲线 B为肾透明细胞癌的预测模型及预测效果。
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图8 肾透明细胞癌预后预测校正图及列线图
1.9 FBXO38高低表达构建KM曲线
OS中位数5.0516,DSS中位数4.7538分组分为高低表达两组,发现OS,DSS,PFI的高低表达都差异显著,且高表达的FBXO38有较好的预后效果,结果如图9。
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图9 FBXO38高低表达KM生存曲线
1.10 免疫组化检测肾透明细胞癌肿瘤组织中的FBXO38表达量低于癌旁组织
FBXO38的亚细胞定位为胞浆,细胞质中,免疫组化结果可见在相同的标尺下,肾透明细胞癌肿瘤组织中的FBXO38表达量低于癌旁组织,与预测结果相符。
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图10 FBXO38在肿瘤组织及癌旁的免疫组化图
1.11 CCK-8细胞检测结果
利用Graphpad Prism 10.1.2中的Two-way ANOVA分析中多重比较分析不同药物浓度中高表达FBXO38组与控制组之间是否存在差异 ,由图发现6.25、12.5、25mg/ml中控制组和高表达FBXO38组肾透明细胞癌细胞活力存在统计学差异(校正后P值6.25与12.5均<0.0001,25组为0.0017),同时高表达FBXO38的肾透明细胞癌细胞对治疗药物硫酸长春新碱更敏感,药物治疗效果更好如下图11,CCK-8法检测FBXO38高表达肾透明细胞癌细胞对药物治疗更敏感,药物治疗效果更好,差异有统计学意义 
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图11 CCK-8法预测FBXO38不同表达量对于细胞增殖影响结果图
*P<0.05 * *P<0.01。
1.12 划痕实验结果
利用Graphpad Prism 10.1.2中的单因素方差分析(利用多重比较)和T检验分析正常表达及过表达FBXO38的细胞面积在0、12、18h的统计学差异,发现在过表达FBXO38组除12、18h之间不存在统计学差异,0和12h、0和18h存在统计学差异(P=0.0292,P=0.0032);控制组0和12h、0和18h、12和18h均存在统计学差异(P<0.0001,P<0.0001,P=0.0032);并发现12、18h的细胞愈合面积过表达FBXO38组(29%、50%)均低于正常组(58%、80%)且具有统计学差异(P=0.0403,P=0.0350),过表达的FBXO38降低了肾透明细胞瘤细胞的迁移,如图12,A 划痕实验检测高表达FBXO38对于细胞迁移能力的影响(×40) B 观测组和FBXO38高表达组不同时间迁移差异图 C 观测组和FBXO38高表达组不同时间愈合面积的差异图,红色为12h,绿色为18h *P<0.05 **P<0.01 ***P<0.001 ****P<0.0001。
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图12 划痕实验验证细胞迁移能力结果图
1.13 Transwell法检测细胞的迁移能力
两组细胞均穿膜,与正常KIRC相比,FBXO38迁移细胞数少于对照组,迁移能力降低(P=0.0005)如图13,A为FBXO38高表达组 B为对照组,***P<0.001 。
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图13 Transwell法检测细胞迁移结果图
1.14 流式实验检测T细胞对肿瘤细胞的杀伤
T细胞对肿瘤细胞杀伤实验中,过表达FBXO38细胞死亡率更高,对照组T细胞平均杀伤率为34.07%,过表达FBXO38组,T细胞平均杀伤率为41.7%,发现T细胞杀伤率差异显著(P=0.02<0.05),T细胞对高表达FBXO38的肾透明细胞癌细胞有较好的杀伤效果,结果如下图14。
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图14 流式细胞术结果图
第2部分GEO数据库中弥漫大B细胞瘤患者中FBXO38的生物信息学验证结果
2.1 FBXO38在生存的弥漫大B细胞淋巴瘤患者、接受R-CHOP治疗的患者、癌旁组织的表达更高。
整理GSE10846中患者的病理特征如生存死亡、年龄、ECOG、治疗方式等并按照FBXO38表达从低到高排序,绘制成图1A上部分表示患者的生存死亡情况,下部分表明不同FBXO38表达量患者的病理特征。通过不同的检验方法发现接受R-CHOP治疗的患者FBXO38基因的表达量比单用CHOP方法高,同时FBXO38的表达量在生存的DLBC患者中表达高于死亡的DLBC患者;HPA下载的免疫组化图也显示癌旁组织的FBXO38蛋白表达高于癌症组织,具体见图15,A GSE10846中患者的病理特征信息图 B、C生存和R-CHOP治疗的DLBC患者FBXO38表达量更高 D、E FBXO38蛋白在癌旁组织表达量更高***P<0.001,****P<0.0001。
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图15 患者信息图、表达差异图
2.2 通路分析结果
根据STRING网站发现FBXO38与RNF169、USP7、WDR48、RBX1等蛋白相关度较高。RNF169为E3泛素蛋白连接酶,作为DNA损伤后双链断裂(DSB)修复的负调节因子。USP7是一种去泛素化酶,目前有研究发现USP7在多癌症中高表达,是癌症标志的重要调节因子,WDR48、RBX1等蛋白都是泛素化蛋白,且大部分都与癌症相关。将STRING分析的50个蛋白及其相关基因进行GO/KEGG富集分析,发现蛋白酶体泛素依赖性蛋白分解代谢过程可能为其生物作用过程;作用的细胞组分可能为泛素连接酶复合物等相关;分子功能可能是泛素蛋白转移酶活性等,同时信号通路可能与泛素蛋白水解生物节律等相关并绘制气泡图,我们可以看到每个通路的显著性和离群程度;绘制圈图可以看到每个通路富集到的基因是上调还是下调;弦图可以看见哪些基因作用同一条通路,结果如下图16,A 蛋白互作网络图 B 气泡图 C 圈图 D 弦图。
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图16 PPI、GO/KEGG分析图
将Pearson算法算出的580个基因利用DAVID网站进行GO/KEGG分析,发现可能的生物学过程是mRNA加工、RNA剪接、RNA聚合酶II启动子的转录正调控等;生物组分可能在核浆核质等处;跟RNA、蛋白、ATP连接分子功能相关;沙门氏菌感染、内吞作用、内质网中的蛋白质加工等KEGG通路有关,结果如下图17。并将基因按照相关性与显著性绘制火山图,并选择正负相关性前50的基因绘制基因表达热图见图18。
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图17 FBXO38及相关基因的GO/KEGG分析
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图18 火山图及基因表达热图
A 为根据相关性绘制的火山图右侧黄色代表R>0.3的基因,左侧绿色为R<-0.3的基因 B、C 为与FBXO38正、负相关性最高的50个基因绘制的相关性热图
2.3 GSEA分析结果
利用T检验将CHOP与R-CHOP中基因的差异表达进行比较,并将R-CHOP/CHOP>1.5定义为基因高表达,<0.8定义为低表达,绘制成图19A的火山图,同时利用Pearson算法选择与FBXO38显著相关的789个基因进行GSEA分析,发现这些基因最可能的通路为细胞周期、细胞周期过程、有丝分裂细胞周期,无论时是P值或是校正后P值均显著,并且富集的基因大多分布在FC为正的区间,结果如下图B、C。
图19火山图及GSEA分析结果图
A:火山图红色为FC>1.5的基因蓝色为FC<0.8的基因 B为整体的GSEA分析情况,C为将每个通路具体展示,并标注了显著的基因及NES、Pvalue值以及校正后P值
2.4 相关性分析结果
Pearson算法发现FBXO38与HVEM、CD200R1、GITR、CD137、CD40、B7H4显著相关,其中CD200R1与CD40与FBXO38为正相关性,其余为负相关性;Spearman算法发现HVEM、CD200R1、GITR、CD137、CD27L、B7H4与FBXO38显著相关,其中CD200R1与FBXO38为正相关性,其余为负相关性结果如下图20。
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图20 FBXO38与免疫检查点的相关性图
A FBXO38与免疫检查点相关性热图 B-G相关性散点图
利用Pearson算法计算FBXO38与趋化因子的相关性及显著性,结果如下图21A,发现12种趋化因子与FBXO38显著相关,其中CCL1等4种趋化因子为正相关性,CCL3等8种趋化因子为负相关性;利用ssGSEA算法分析28种免疫浸润细胞的相关性热图如下图B;同时利用ssGSEA算法分析FBXO38的高低表达对于免疫浸润细胞是否存在差异性,结果发现活化的CD4 T细胞等11种免疫浸润细胞FBXO38高低表达存在差异性,并发现除了浆细胞样树突状细胞在高表达的FBXO38中表达较低,CD4 T细胞、中枢记忆CD8 T细胞、效应记忆CD4 T细胞、γδT细胞、未成熟B细胞、巨噬细胞、肥大细胞、单核细胞、自然杀伤细胞、2型T辅助细胞均在高表达的FBXO38组表达较高,结果如图C,A 趋化因子与FBXO38相关性棒棒糖图点的大小代表相关性,颜色代表显著性 B 28种免疫浸润细胞的相关性热图 C FBXO38高低表达在28种免疫浸润细胞的表达差异图,左侧棕色为FBXO38低表达组右侧蓝色为FBXO38高表达组。
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图21 FBXO38与趋化因子及免疫浸润细胞的相关性分析
2.5 FBXO38对于DLBC的预后价值结果
利用SPSS 27.0进行生存回归COX分析,在单因素分析中发现年龄为危险因素(HR=1.030 P<0.001),尤其是>60的患者是危险因素(HR=2.175,P<0.001),,癌症分型中ABC的危害性最高,R-CHOP治疗是DLBC患者是保护因素(HR=0.517 ,P<0.001),Stage分期越高,危害越高,LDH ratio>2(HR=2.374,P<0.001),结外受侵部位(HR=1.997,P=0.008)>2为危害因素,FBXO38为保护因素(HR=0.902,P=0.026),IPI与ECOG评分越高,危害性越强。通过多因素COX分析证明FBXO38、癌症分型、Stage分期、IPI、ECOG为独立风险因素,其中FBXO38为保护因素(HR=0.886,P=0.016),癌症分型中ABC的危害性最高,Stage分期越高,危害越高,IPI与ECOG评分越高,危害性越强。
表3 单因素Cox分析
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表4 多因素Cox分析
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列线图根据分数预测每个病理特征与患者的生存率关联性,从图中我们可得男性、年龄越高、肿瘤分型为ABC、治疗方式为CHOP、ECOG、IPI评分越高、StageII期、LDH ratio、结外受侵部位越高、FBXO38表达越低,评分越高,最终生存率也越低;列线图校正曲线预测生存率拟合点和理想线波动幅度不大,拟合较好,说明我们的预后模型构建较好;时间依赖性ROC曲线发现AUC均小于0.5,说明FBXO38为保护因素,且其的表达与生存率有关系,结果如下图22,A评分越高,生存率也越低,明确了哪些病理特征对患者的预后更好B 模型构建拟合程度较高,说明预测结果较可靠 C说明FBXO38对于DLBC有较好的预后效果。
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图22预后价值预测结果图
将FBXO38按照高低表达分为两组绘制KM曲线(M=6.48);根据列线图预测的风险评分分为高低两组绘制KM曲线(M=-0.41),结果发现高表达的FBXO38与低风险评分的患者,生存可能性越高,预后效果越好,结果如图23,A 高表达FBXO38患者预后效果更好 B列线图预测的风险评分越低,预后效果越好。
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图23 预后效果差异图
2.6 CCK-8细胞检测结果
实验中测定了药物的半数最大抑制浓度(IC50),以验证细胞活力。CCK8检测结果显示,过表达组细胞的增殖活性明显受到抑制。FBXO38过表达组的IC50值(9.7 μM)明显低于对照组(12.95 μM), p < 0.05,提示FBXO38过表达可能增强了细胞对药物的敏感性。这一差异表明FBXO38在调节药物诱导的细胞凋亡或与细胞毒性相关的信号通路中的潜在作用。
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图24过表达FBXO38的DLBC细胞比正常FBXO38组对药物更敏感
2.7 流动法检测T细胞杀伤肿瘤细胞
对照组T细胞平均杀伤率为4.7%,过表达fbxo38组T细胞平均杀伤率为14.35%,差异有统计学意义(P = 0.02 < 0.05)。这些发现表明,高表达FBXO38的T细胞对DLBC具有增强的细胞毒作用。
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图25 T细胞对过表达FBXO38的DLBC细胞的杀伤作用大于对正常表达FBXO38的DLBC细胞的杀伤作用
第七部分 概述FBXO38与实体瘤和血液瘤共同的作用机制
一、FBXO38的生物学功能与机制
PD-1泛素化调控与免疫治疗靶
FBXO38作为SCF E3泛素连接酶复合物的成员,通过泛素-蛋白酶体系统降解PD-1蛋白,增强T细胞的抗肿瘤活性。在KIRC中,FBXO38低表达导致PD-1在肿瘤浸润T细胞中积累,抑制免疫应答,促进肿瘤进展。这一机制在DLBCL中同样适用,FBXO38可能通过拮抗去泛素酶USP7的活性,打破PD-1/USP7轴平衡,改善T细胞功能。
DNA修复与代谢调控
FBXO38与RNF169(DNA损伤修复相关E3连接酶)相互作用,通过调控DNA双链断裂修复(DSB)维持基因组稳定性。在KIRC中,RNF169功能异常可能加剧代谢异常(如Warburg效应),而FBXO38缺失可能通过糖酵解和自噬失调促进肿瘤发生。DLBCL中,FBXO38与RNF169的互作可能影响基因组不稳定性,尤其在“双打击”淋巴瘤中具有治疗潜力。
免疫微环境调节
KIRC:FBXO38低表达与免疫抑制性微环境相关,如调节性T细胞(Tregs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)浸润增加,抑制抗肿瘤免疫。
DLBCL:FBXO38高表达可能抑制TAMs的M2型极化,减少IL-10和Arg1分泌,重塑促炎微环境。此外,FBXO38表达与B细胞、CD8+ T细胞浸润正相关,提示其对免疫细胞功能的调控作用。
二、FBXO38作为预后标志物的证据
表达水平与临床预后
KIRC:TCGA数据显示,FBXO38表达随病理分期升高而降低,低表达患者总生存率显著较差(5年生存率<10% vs. 高表达组)。HPA数据库及免疫组化证实肿瘤组织中FBXO38蛋白水平低于癌旁组织。
DLBCL:GSE10846数据集分析显示,FBXO38高表达患者总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)更优(HR=0.62,p<0.05),且与IPI评分、Ann Arbor分期负相关。
分子分型与治疗响应
KIRC:FBXO38联合TNM分期可提高预后模型准确性,类似ACE2、RAC2等标志物。
DLBCL:GCB亚型中FBXO38表达高于ABC亚型(p=0.03),可能部分解释GCB亚型更优的5年生存率(87-92% vs. 44%)。低FBXO38与NF-κB通路激活相关,提示对伊布替尼的敏感性差异。
三、靶向治疗潜力与策略
免疫治疗联合
FBXO38激动剂(如小分子化合物)联合PD-1/PD-L1抑制剂(帕博利珠单抗)可协同增强T细胞功能。临床前研究显示,USP7抑制剂(P5091)通过稳定FBXO38活性提升免疫治疗效果。
在DLBCL中,FBXO38与PD-1阻断剂的联用已在复发/难治性患者中展现潜力。
泛素化通路干预
FBXO38可能通过降解致癌蛋白(如MYC、BCL2)发挥抑癌作用。类似c-Cbl通过泛素化Wnt/β-catenin通路蛋白抑制肿瘤的机制,FBXO38或可成为DLBCL中靶向“双打击”淋巴瘤的新策略。
微环境调控
纳米载体递送FBXO38激动剂至TAMs,逆转M2型极化,抑制IL-10分泌,重塑抗肿瘤免疫微环境。
总结
FBXO38在KIRC和DLBCL中均通过泛素化调控PD-1、DNA修复和免疫微环境重塑发挥关键作用,其低表达提示不良预后。作为新型免疫治疗靶点和预后标志物,FBXO38的激动剂开发及联合治疗策略为改善实体瘤和血液瘤疗效提供了新方向。
已具备的条件
①仪器设备完善
我们所依附的实验室是P2实验室,省级重点实验室,济宁医学院“泰山学者”专家实验室。建有专门的分子生物学实验室、蛋白纯化实验室、细胞生物学实验室、动物实验室等,实验室拥有近2000万元的仪器设备,完全满足与该项目相关的实验条件,如凝胶成像分析系统、蛋白电泳及转印系统、成像分析系统、各种容量的离心机、无菌层流室和超净台、活细胞工作站、活体光学成像系统、ECM830电转化仪、TMQ.R-3250型自动台式灭菌器、自动控温摇床、日本产KUBOTA  KR/702型低温离心机、CO2培养箱、流式细胞仪、紫外可见双通道可控温分光光度仪(岛津UV-160,JAPAN)、酶联免疫测定仪、凝胶电泳成像系统(Gel Doc2000,BIO RAD,USA)、荧光定量PCR、超纯水系统、等仪器设备及设施。
②试剂
细胞因子的ELISA试剂盒,LgM、LgG的ELISA试剂盒,流式细胞检测相应的耗材实验室具备,不需购买。还有关于FBXO38在不同癌症组织的培养基等
尚缺少的条件
购买裸鼠、合成FBXO38的片段,进行验证实验。
解决方法
积极着手开始合成片段及其他工作。

经费预算

开支科目 预算经费(元) 主要用途 阶段下达经费计划(元)
前半阶段 后半阶段
预算经费总额 20000.00 13000.00 7000.00
1. 业务费 13000.00 9000.00 4000.00
(1)计算、分析、测试费 5000.00 5000.00 0.00
(2)能源动力费 0.00 0.00 0.00
(3)会议、差旅费 0.00 0.00 0.00
(4)文献检索费 0.00 0.00 0.00
(5)论文出版费 8000.00 4000.00 4000.00
2. 仪器设备购置费 0.00 0.00 0.00
3. 实验装置试制费 0.00 0.00 0.00
4. 材料费 7000.00 4000.00 3000.00
结束